中央に円形を配し，石別小の三字を入れ，学校の発展と円満な人格を願っている。 中央の円形から六方向にペンと桜の葉を形取り，ペンは「知」「徳」「体」を表し，三方向に広がる葉は「自立」「創造」「勤勉」を表している。 （校章制定 T14．5．15）
